Structural Analysis for Java

ずいぶん古いものだけど

IBMのalphaWorksにStructural Analysis for Javaがある

http://www.alphaworks.ibm.com/tech/sa4j

なかなか便利だった。

コールグラフの可視化ツール情報
http://www.evernote.com/pub/plutonium186/TheNotebook#n=d0885d42-6752-4531-8332-5ea1753df500

Dynagraph
http://www.dynagraph.org/applications.php

GUESS
http://graphexploration.cond.org/

http://muffin.cias.osakafu-u.ac.jp/~matumoto/cgi-bin/xt.cgi?linux/graphic_tools